Das Hotel Ndalem Malioboro Yogyakarta liegt weniger als 1 km vom Taman Pintar Wissenschaftspark und 5 Minuten zu Fuß von der Taru Martani entfernt.
Die Pension ist im Bezirk Gondokusuman von Yogyakarta, in etwa 10 Gehminuten Entfernung vom Bahnhof Lempuyangan gelegen. Das Wasserschloss befindet sich in rund 2 km Entfernung von dem 2-Sterne-Hotel. Das Ndalem Malioboro liegt in einer Entfernung von circa 10 Autominuten vom Museum Sonobudoyo. Die Bushaltestelle STP Wisma Nendra ist ein paar Schritte entfernt von der Unterkunft.
Nur 150 Meter vom Hotel entfernt, lädt das Restaurant Kedai Rakyat Djelata zum Speisen ein.